Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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