Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms