Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms