Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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