Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Krt40Q6IFX3 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Krt40Q6IFX3 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Krt40Q6IFX3 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
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Krt40Q6IFX3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Krt40Q6IFX3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Krt40Q6IFX3 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Krt40Q6IFX3 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Krt40Q6IFX3 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Krt40Q6IFX3 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Krt40Q6IFX3 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Krt40Q6IFX3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Krt40Q6IFX3 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Krt40Q6IFX3 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
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Krt40Q6IFX3 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
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