Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atg9bQ6EBV9 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Atg9bQ6EBV9 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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