Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CltcQ68FD5 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CltcQ68FD5 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CltcQ68FD5 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CltcQ68FD5 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CltcQ68FD5 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CltcQ68FD5 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CltcQ68FD5 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CltcQ68FD5 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CltcQ68FD5 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CltcQ68FD5 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CltcQ68FD5 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CltcQ68FD5 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CltcQ68FD5 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CltcQ68FD5 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms