Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Irf4Q64287 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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