Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ift52Q62559 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms