Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sall3Q62255 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sall3Q62255 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Sall3Q62255 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Sall3Q62255 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sall3Q62255 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sall3Q62255 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sall3Q62255 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sall3Q62255 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sall3Q62255 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sall3Q62255 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sall3Q62255 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sall3Q62255 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sall3Q62255 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sall3Q62255 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sall3Q62255 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Sall3Q62255 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Sall3Q62255 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Sall3Q62255 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Sall3Q62255 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Sall3Q62255 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sall3Q62255 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sall3Q62255 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sall3Q62255 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sall3Q62255 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sall3Q62255 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sall3Q62255 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sall3Q62255 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sall3Q62255 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sall3Q62255 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sall3Q62255 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Sall3Q62255 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sall3Q62255 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sall3Q62255 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sall3Q62255 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sall3Q62255 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sall3Q62255 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sall3Q62255 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Sall3Q62255 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Sall3Q62255 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sall3Q62255 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Sall3Q62255 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Sall3Q62255 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Sall3Q62255 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sall3Q62255 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sall3Q62255 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sall3Q62255 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sall3Q62255 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sall3Q62255 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sall3Q62255 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sall3Q62255 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sall3Q62255 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sall3Q62255 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sall3Q62255 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sall3Q62255 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sall3Q62255 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sall3Q62255 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sall3Q62255 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sall3Q62255 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Sall3Q62255 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sall3Q62255 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sall3Q62255 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sall3Q62255 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sall3Q62255 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sall3Q62255 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sall3Q62255 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sall3Q62255 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sall3Q62255 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sall3Q62255 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sall3Q62255 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sall3Q62255 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sall3Q62255 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sall3Q62255 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sall3Q62255 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sall3Q62255 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sall3Q62255 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sall3Q62255 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sall3Q62255 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sall3Q62255 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sall3Q62255 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sall3Q62255 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Sall3Q62255 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sall3Q62255 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sall3Q62255 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sall3Q62255 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Sall3Q62255 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sall3Q62255 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sall3Q62255 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Sall3Q62255 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sall3Q62255 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sall3Q62255 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Sall3Q62255 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Sall3Q62255 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sall3Q62255 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sall3Q62255 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sall3Q62255 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sall3Q62255 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sall3Q62255 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sall3Q62255 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sall3Q62255 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms