Protein–RNA interactions for Protein: Q62241

Snrpc, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpcQ62241 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SnrpcQ62241 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SnrpcQ62241 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SnrpcQ62241 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SnrpcQ62241 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SnrpcQ62241 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SnrpcQ62241 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SnrpcQ62241 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SnrpcQ62241 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SnrpcQ62241 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SnrpcQ62241 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SnrpcQ62241 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SnrpcQ62241 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SnrpcQ62241 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SnrpcQ62241 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SnrpcQ62241 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SnrpcQ62241 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms