Protein–RNA interactions for Protein: Q61220

Nell2, Protein kinase C-binding protein NELL2, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nell2Q61220 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Nell2Q61220 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Nell2Q61220 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms