Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms