Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CttnQ60598 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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CttnQ60598 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CttnQ60598 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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CttnQ60598 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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CttnQ60598 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CttnQ60598 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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CttnQ60598 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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CttnQ60598 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CttnQ60598 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CttnQ60598 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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CttnQ60598 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CttnQ60598 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CttnQ60598 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CttnQ60598 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CttnQ60598 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CttnQ60598 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CttnQ60598 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CttnQ60598 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CttnQ60598 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CttnQ60598 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CttnQ60598 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CttnQ60598 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CttnQ60598 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CttnQ60598 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CttnQ60598 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CttnQ60598 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CttnQ60598 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CttnQ60598 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
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