Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sin3aQ60520 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms