Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

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Length 803 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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Tsr1Q5SWD9 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Tsr1Q5SWD9 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Tsr1Q5SWD9 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Tsr1Q5SWD9 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Tsr1Q5SWD9 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tsr1Q5SWD9 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Tsr1Q5SWD9 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Tsr1Q5SWD9 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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