Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sft2d1Q5SSN7 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms