Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZF3

Ddx49, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ddx49Q4FZF3 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Ddx49Q4FZF3 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Ddx49Q4FZF3 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC16■□□□□ 0.15
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Ddx49Q4FZF3 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Ddx49Q4FZF3 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ddx49Q4FZF3 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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