Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ulk4Q3V129 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ulk4Q3V129 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ulk4Q3V129 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ulk4Q3V129 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ulk4Q3V129 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ulk4Q3V129 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ulk4Q3V129 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ulk4Q3V129 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ulk4Q3V129 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ulk4Q3V129 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ulk4Q3V129 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ulk4Q3V129 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ulk4Q3V129 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ulk4Q3V129 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ulk4Q3V129 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ulk4Q3V129 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ulk4Q3V129 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ulk4Q3V129 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ulk4Q3V129 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ulk4Q3V129 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ulk4Q3V129 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ulk4Q3V129 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ulk4Q3V129 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ulk4Q3V129 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ulk4Q3V129 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ulk4Q3V129 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ulk4Q3V129 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ulk4Q3V129 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ulk4Q3V129 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ulk4Q3V129 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ulk4Q3V129 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ulk4Q3V129 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ulk4Q3V129 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ulk4Q3V129 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ulk4Q3V129 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ulk4Q3V129 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ulk4Q3V129 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ulk4Q3V129 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ulk4Q3V129 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ulk4Q3V129 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ulk4Q3V129 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ulk4Q3V129 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ulk4Q3V129 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ulk4Q3V129 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ulk4Q3V129 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ulk4Q3V129 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ulk4Q3V129 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ulk4Q3V129 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ulk4Q3V129 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ulk4Q3V129 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ulk4Q3V129 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ulk4Q3V129 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ulk4Q3V129 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ulk4Q3V129 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ulk4Q3V129 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ulk4Q3V129 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ulk4Q3V129 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ulk4Q3V129 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ulk4Q3V129 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ulk4Q3V129 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ulk4Q3V129 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ulk4Q3V129 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ulk4Q3V129 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms