Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Gm44286-201ENSMUST00000204098 1487 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Gm1866-201ENSMUST00000120701 477 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Gm1715-201ENSMUST00000213681 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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Lrrc43Q3V0L5 Tprkb-202ENSMUST00000089570 1216 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Milr1-202ENSMUST00000106794 1514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Gm6938-201ENSMUST00000123014 771 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Gm16337-201ENSMUST00000160368 917 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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Lrrc43Q3V0L5 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 4930442G15Rik-201ENSMUST00000213112 1000 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
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Lrrc43Q3V0L5 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Gm4791-201ENSMUST00000178065 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Il6-204ENSMUST00000199765 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc54-201ENSMUST00000062439 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms