Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Znf48Q3US17 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Znf48Q3US17 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Znf48Q3US17 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Znf48Q3US17 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Znf48Q3US17 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Znf48Q3US17 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Znf48Q3US17 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Znf48Q3US17 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Znf48Q3US17 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Znf48Q3US17 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Znf48Q3US17 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Znf48Q3US17 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Znf48Q3US17 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Znf48Q3US17 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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