Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sec31aQ3UPL0 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms