Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc33Q3ULW6 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms