Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ22

Gm648, Gene model 648, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm648Q3UJ22 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm648Q3UJ22 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms