Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms