Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHH1

Zswim8, Zinc finger SWIM domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,832 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zswim8Q3UHH1 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Zswim8Q3UHH1 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Zswim8Q3UHH1 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Zswim8Q3UHH1 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Zswim8Q3UHH1 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Zswim8Q3UHH1 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zswim8Q3UHH1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zswim8Q3UHH1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zswim8Q3UHH1 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zswim8Q3UHH1 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms