Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Snx27Q3UHD6 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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