Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms