Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms