Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms