Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ptcd3Q14C51 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptcd3Q14C51 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptcd3Q14C51 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptcd3Q14C51 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptcd3Q14C51 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptcd3Q14C51 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptcd3Q14C51 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptcd3Q14C51 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptcd3Q14C51 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptcd3Q14C51 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptcd3Q14C51 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptcd3Q14C51 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptcd3Q14C51 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptcd3Q14C51 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptcd3Q14C51 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptcd3Q14C51 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptcd3Q14C51 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptcd3Q14C51 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptcd3Q14C51 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptcd3Q14C51 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptcd3Q14C51 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptcd3Q14C51 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptcd3Q14C51 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptcd3Q14C51 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptcd3Q14C51 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptcd3Q14C51 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptcd3Q14C51 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptcd3Q14C51 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptcd3Q14C51 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptcd3Q14C51 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptcd3Q14C51 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptcd3Q14C51 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptcd3Q14C51 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptcd3Q14C51 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptcd3Q14C51 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptcd3Q14C51 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptcd3Q14C51 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptcd3Q14C51 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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