Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
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ptchd1Q14B62 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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ptchd1Q14B62 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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ptchd1Q14B62 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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ptchd1Q14B62 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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ptchd1Q14B62 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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ptchd1Q14B62 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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