Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms