Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Cntnap5cQ0V8T7 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms