Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttc21bQ0HA38 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms