Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
1700061G19RikQ08EE8 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
1700061G19RikQ08EE8 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms