Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MitfQ08874 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
MitfQ08874 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
MitfQ08874 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
MitfQ08874 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
MitfQ08874 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
MitfQ08874 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MitfQ08874 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MitfQ08874 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MitfQ08874 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms