Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MestQ07646 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MestQ07646 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
MestQ07646 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MestQ07646 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
MestQ07646 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MestQ07646 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
MestQ07646 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MestQ07646 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MestQ07646 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MestQ07646 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
MestQ07646 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MestQ07646 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MestQ07646 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MestQ07646 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MestQ07646 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
MestQ07646 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MestQ07646 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MestQ07646 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MestQ07646 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MestQ07646 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
MestQ07646 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
MestQ07646 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
MestQ07646 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
MestQ07646 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
MestQ07646 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
MestQ07646 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MestQ07646 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
MestQ07646 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MestQ07646 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MestQ07646 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MestQ07646 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
MestQ07646 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MestQ07646 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MestQ07646 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
MestQ07646 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
MestQ07646 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MestQ07646 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
MestQ07646 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MestQ07646 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
MestQ07646 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MestQ07646 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MestQ07646 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MestQ07646 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MestQ07646 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MestQ07646 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MestQ07646 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MestQ07646 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MestQ07646 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MestQ07646 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MestQ07646 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
MestQ07646 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MestQ07646 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
MestQ07646 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MestQ07646 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
MestQ07646 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MestQ07646 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
MestQ07646 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MestQ07646 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
MestQ07646 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
MestQ07646 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
MestQ07646 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MestQ07646 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
MestQ07646 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
MestQ07646 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MestQ07646 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MestQ07646 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MestQ07646 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
MestQ07646 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
MestQ07646 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MestQ07646 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MestQ07646 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MestQ07646 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MestQ07646 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
MestQ07646 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
MestQ07646 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MestQ07646 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MestQ07646 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MestQ07646 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MestQ07646 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
MestQ07646 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MestQ07646 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MestQ07646 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
MestQ07646 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MestQ07646 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MestQ07646 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MestQ07646 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
MestQ07646 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MestQ07646 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
MestQ07646 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
MestQ07646 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MestQ07646 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
MestQ07646 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MestQ07646 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MestQ07646 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MestQ07646 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MestQ07646 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
MestQ07646 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
MestQ07646 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MestQ07646 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms