Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sh3bp2Q06649 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sh3bp2Q06649 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sh3bp2Q06649 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sh3bp2Q06649 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sh3bp2Q06649 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sh3bp2Q06649 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sh3bp2Q06649 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sh3bp2Q06649 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sh3bp2Q06649 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sh3bp2Q06649 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sh3bp2Q06649 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Sh3bp2Q06649 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Sh3bp2Q06649 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Sh3bp2Q06649 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Sh3bp2Q06649 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Sh3bp2Q06649 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sh3bp2Q06649 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sh3bp2Q06649 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sh3bp2Q06649 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sh3bp2Q06649 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Sh3bp2Q06649 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Sh3bp2Q06649 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Sh3bp2Q06649 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Sh3bp2Q06649 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Sh3bp2Q06649 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Sh3bp2Q06649 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Sh3bp2Q06649 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sh3bp2Q06649 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Sh3bp2Q06649 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Sh3bp2Q06649 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sh3bp2Q06649 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sh3bp2Q06649 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sh3bp2Q06649 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sh3bp2Q06649 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sh3bp2Q06649 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sh3bp2Q06649 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sh3bp2Q06649 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sh3bp2Q06649 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sh3bp2Q06649 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sh3bp2Q06649 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sh3bp2Q06649 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sh3bp2Q06649 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sh3bp2Q06649 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sh3bp2Q06649 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
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Sh3bp2Q06649 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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Sh3bp2Q06649 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
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Sh3bp2Q06649 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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