Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smarcad1Q04692 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smarcad1Q04692 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smarcad1Q04692 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smarcad1Q04692 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smarcad1Q04692 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smarcad1Q04692 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smarcad1Q04692 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smarcad1Q04692 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smarcad1Q04692 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smarcad1Q04692 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Smarcad1Q04692 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smarcad1Q04692 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smarcad1Q04692 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smarcad1Q04692 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smarcad1Q04692 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smarcad1Q04692 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Smarcad1Q04692 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smarcad1Q04692 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smarcad1Q04692 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smarcad1Q04692 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smarcad1Q04692 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smarcad1Q04692 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smarcad1Q04692 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smarcad1Q04692 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smarcad1Q04692 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smarcad1Q04692 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smarcad1Q04692 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smarcad1Q04692 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smarcad1Q04692 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smarcad1Q04692 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smarcad1Q04692 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smarcad1Q04692 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smarcad1Q04692 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smarcad1Q04692 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smarcad1Q04692 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smarcad1Q04692 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smarcad1Q04692 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smarcad1Q04692 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smarcad1Q04692 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smarcad1Q04692 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smarcad1Q04692 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smarcad1Q04692 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smarcad1Q04692 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smarcad1Q04692 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smarcad1Q04692 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smarcad1Q04692 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smarcad1Q04692 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smarcad1Q04692 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smarcad1Q04692 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smarcad1Q04692 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smarcad1Q04692 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smarcad1Q04692 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smarcad1Q04692 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Smarcad1Q04692 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smarcad1Q04692 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smarcad1Q04692 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smarcad1Q04692 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smarcad1Q04692 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smarcad1Q04692 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smarcad1Q04692 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smarcad1Q04692 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smarcad1Q04692 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smarcad1Q04692 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smarcad1Q04692 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smarcad1Q04692 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smarcad1Q04692 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smarcad1Q04692 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcad1Q04692 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcad1Q04692 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcad1Q04692 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcad1Q04692 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcad1Q04692 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcad1Q04692 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcad1Q04692 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcad1Q04692 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcad1Q04692 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcad1Q04692 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcad1Q04692 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcad1Q04692 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcad1Q04692 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcad1Q04692 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcad1Q04692 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcad1Q04692 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcad1Q04692 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcad1Q04692 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcad1Q04692 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcad1Q04692 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcad1Q04692 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcad1Q04692 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcad1Q04692 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcad1Q04692 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcad1Q04692 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcad1Q04692 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcad1Q04692 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcad1Q04692 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcad1Q04692 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcad1Q04692 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcad1Q04692 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcad1Q04692 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms