Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms