Protein–RNA interactions for Protein: Q03142

Fgfr4, Fibroblast growth factor receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr4Q03142 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fgfr4Q03142 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fgfr4Q03142 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fgfr4Q03142 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fgfr4Q03142 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Fgfr4Q03142 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Fgfr4Q03142 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fgfr4Q03142 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fgfr4Q03142 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Fgfr4Q03142 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Fgfr4Q03142 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fgfr4Q03142 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fgfr4Q03142 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fgfr4Q03142 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fgfr4Q03142 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fgfr4Q03142 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fgfr4Q03142 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fgfr4Q03142 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fgfr4Q03142 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fgfr4Q03142 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fgfr4Q03142 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fgfr4Q03142 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Fgfr4Q03142 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fgfr4Q03142 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fgfr4Q03142 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fgfr4Q03142 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fgfr4Q03142 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fgfr4Q03142 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fgfr4Q03142 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fgfr4Q03142 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fgfr4Q03142 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fgfr4Q03142 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fgfr4Q03142 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fgfr4Q03142 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Fgfr4Q03142 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fgfr4Q03142 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Fgfr4Q03142 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fgfr4Q03142 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Fgfr4Q03142 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fgfr4Q03142 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fgfr4Q03142 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fgfr4Q03142 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fgfr4Q03142 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Fgfr4Q03142 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fgfr4Q03142 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Fgfr4Q03142 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fgfr4Q03142 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fgfr4Q03142 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fgfr4Q03142 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Fgfr4Q03142 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fgfr4Q03142 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fgfr4Q03142 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Fgfr4Q03142 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fgfr4Q03142 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fgfr4Q03142 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Fgfr4Q03142 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fgfr4Q03142 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fgfr4Q03142 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Fgfr4Q03142 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fgfr4Q03142 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fgfr4Q03142 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Fgfr4Q03142 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fgfr4Q03142 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Fgfr4Q03142 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fgfr4Q03142 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fgfr4Q03142 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Fgfr4Q03142 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fgfr4Q03142 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fgfr4Q03142 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fgfr4Q03142 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fgfr4Q03142 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fgfr4Q03142 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fgfr4Q03142 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fgfr4Q03142 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fgfr4Q03142 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fgfr4Q03142 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fgfr4Q03142 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fgfr4Q03142 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fgfr4Q03142 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fgfr4Q03142 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fgfr4Q03142 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fgfr4Q03142 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fgfr4Q03142 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms