Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms