Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Grin2bQ01097 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms