Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
PrcdQ00LT2 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms