Protein–RNA interactions for Protein: Q00175

Pgr, Progesterone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgrQ00175 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PgrQ00175 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PgrQ00175 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PgrQ00175 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PgrQ00175 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PgrQ00175 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PgrQ00175 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PgrQ00175 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PgrQ00175 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PgrQ00175 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PgrQ00175 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PgrQ00175 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PgrQ00175 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PgrQ00175 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PgrQ00175 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PgrQ00175 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PgrQ00175 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PgrQ00175 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PgrQ00175 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PgrQ00175 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PgrQ00175 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PgrQ00175 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PgrQ00175 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PgrQ00175 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PgrQ00175 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PgrQ00175 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PgrQ00175 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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PgrQ00175 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PgrQ00175 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PgrQ00175 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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PgrQ00175 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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PgrQ00175 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PgrQ00175 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PgrQ00175 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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PgrQ00175 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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PgrQ00175 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PgrQ00175 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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PgrQ00175 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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PgrQ00175 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PgrQ00175 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms