Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
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Taf1bP97358 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
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Taf1bP97358 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Taf1bP97358 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Taf1bP97358 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Taf1bP97358 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Taf1bP97358 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf1bP97358 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms