Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SmsP97355 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SmsP97355 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SmsP97355 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SmsP97355 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SmsP97355 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SmsP97355 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SmsP97355 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SmsP97355 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SmsP97355 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SmsP97355 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SmsP97355 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SmsP97355 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SmsP97355 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SmsP97355 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SmsP97355 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SmsP97355 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SmsP97355 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SmsP97355 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SmsP97355 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SmsP97355 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SmsP97355 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SmsP97355 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SmsP97355 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SmsP97355 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SmsP97355 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SmsP97355 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SmsP97355 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SmsP97355 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SmsP97355 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SmsP97355 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SmsP97355 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SmsP97355 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SmsP97355 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SmsP97355 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SmsP97355 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SmsP97355 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SmsP97355 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SmsP97355 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SmsP97355 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SmsP97355 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SmsP97355 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SmsP97355 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SmsP97355 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SmsP97355 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SmsP97355 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SmsP97355 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SmsP97355 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SmsP97355 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SmsP97355 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SmsP97355 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SmsP97355 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SmsP97355 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SmsP97355 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SmsP97355 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SmsP97355 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SmsP97355 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SmsP97355 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SmsP97355 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SmsP97355 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SmsP97355 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SmsP97355 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SmsP97355 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SmsP97355 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SmsP97355 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SmsP97355 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SmsP97355 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SmsP97355 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SmsP97355 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SmsP97355 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SmsP97355 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SmsP97355 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SmsP97355 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SmsP97355 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SmsP97355 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SmsP97355 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SmsP97355 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SmsP97355 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SmsP97355 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SmsP97355 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SmsP97355 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SmsP97355 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SmsP97355 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SmsP97355 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SmsP97355 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SmsP97355 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SmsP97355 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SmsP97355 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SmsP97355 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SmsP97355 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SmsP97355 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SmsP97355 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SmsP97355 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SmsP97355 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SmsP97355 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SmsP97355 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SmsP97355 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SmsP97355 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SmsP97355 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SmsP97355 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms