Protein–RNA interactions for Protein: P82348

Sgcg, Gamma-sarcoglycan, mousemouse

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcgP82348 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgcgP82348 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgcgP82348 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgcgP82348 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgcgP82348 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SgcgP82348 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SgcgP82348 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SgcgP82348 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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