Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Otx2P80206 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Otx2P80206 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Otx2P80206 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Otx2P80206 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Otx2P80206 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Otx2P80206 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Otx2P80206 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Otx2P80206 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Otx2P80206 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Otx2P80206 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Otx2P80206 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Otx2P80206 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Otx2P80206 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Otx2P80206 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Otx2P80206 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Otx2P80206 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Otx2P80206 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Otx2P80206 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Otx2P80206 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Otx2P80206 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Otx2P80206 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Otx2P80206 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Otx2P80206 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Otx2P80206 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms